Se dit des molécules fabriquées par une technique de biologie chimique, telles que les interleukines, l’interféron ou l’insuline, utilisées ensuite comme les produits naturels (par exemple : une interleukine peut être fabriquée à l’aide d’ADN recombinant obtenu en utilisant une souche d’une bactérie nommée Escherichia coli, modifiée génétiquement et porteuse du gène humain de l’IL-2 et productrice de cette cytokine).

Se dit aussi de virus hybrides issus de la combinaison des gènes de VIH différents. On aboutit ainsi à la formation de génotypes nouveaux. Une quinzaine de virus recombinants ont été identifiés dans différentes régions du monde. À terme, on peut craindre l’émergence de virus recombinants multirésistants. Ces virus sont sans doute liés au phénomène de surinfection.